北大六院建立了以院士、长江学者、国家杰出青年基金获得者、“973”计划首席科学家、教育部新世纪人才、国家青年科学基金获得者、博士研究生导师等为学术带头人、中青年科研人员为骨干的临床及基础研究队伍，形成了以心身医学、生物精神病学、社会精神病学、儿童精神病学、临床精神病学、精神药理学六个领域为方向的科研团队。历年来我院承担多项国 家级、省部级和国际合作项目，并获多项重大科研奖励。
在精神药理学研究领域，药理研究室结合基础与临床资源，开展精神疾病的新药研发、病理机制及其临床学研究工作。在情感障碍研究方向，采用先进的分子遗传学、神经生物学、精神药理学及功能影像学等技术或理论，对情感障碍进行系列开拓性研究，并取得重要成果。
北京大学第六医院的老院（简称“北大六院”）坐落在花园北路，和旁边的北医三院相比，显得十分狭小。然而，这里却是精神专科医院的医院之一，收治来自全国的精神科疑难杂症，也是临床医学生进一步选择精神科专业的学习首府。
在临床精神病学领域，着重于以各类主要精神障碍为中心的临床与应用研究、精神临床研究、心理治 疗理论与实践研究、精神行为与神经认知评估工具的开发与应用研究等;主要开展精神分裂症、阿尔茨海默病及轻度认知障碍、老年期抑郁症、双相情感障碍、重性抑郁障碍等常见精神障碍的临床与应用基础研究，积极探索构建主要精神障碍多中心临床研究平台的工作机制，创建了较稳固的全国多中心协同研究网络;在相关疾病的神经生物学机制、早期诊断生物标记物、临床评估与早期干预等领域取得了重要进展。