北京空 军总医院主要承担空 军飞行人员航空病、常见病诊疗防治研究及医学鉴定任务；承担预备航天员的体检选拔任务；承担空 军部队及联勤部队官兵的健康保障和疾病救治；还面向人民群众提供优质医疗服务。已发展成为一所集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型现代化综合性三级甲等医院。
北京空 军总医院积极追踪医学前沿，开展了肝、肾移植，胰肾联合移植，眼角膜移植等多器官移植应用研究；半相合骨髓移植、干细胞移植临床研究；三维适形定向放射治 疗肿瘤应用研究；纤维内窥镜技术应用研究；各种激光治 疗技术应用研究；飞行员飞行心理指导干预；以及腹腔镜、关节镜等各类介入微创技术等。
北京空 军总医院皮肤病科以病人为中心，以质量为核心。全科室医护人员竭诚为每位患者提供精 准的治 疗，帮助很多患者摆脱了疾病的困扰，获得了很多患者和患者家属的一致好评。
北京空 军总医院共编设50多个临床、医技科室，展开床位1500多张，年门诊量200多万人次，收治量约4万人次，手术1.8万台次。有空 军级专家3人，空 军高层次科技人才75人。拥有PET-CT、640排CT、高低场核磁、2微米激光腔镜治 疗系统等高 端科研医疗设备。