保函的办理，特别是分离式保函，也就是通过担保公司办的。保函办理的流程是收集资料，先委托担保合同，银行过审，打款出保函。由于建筑行业存在很多挂靠项目，收集资料和签合同是办理银行保函难的地方，部分项目无法配合签字盖章，造成了银行保函无法成功办理。
保函担保属于信用担保，银行给企业提供信用担保，企业自身的信用比较关键，企业信报上如果有诉讼时，会要求提供相应的处理说明，如果是失信企业，则无法办理银行保函。因此，开始办理银行保函时，都会先查企业征信。
1、基本流程
(1) 营业执照副本、法人代码证副本、税务登记证副本和法定代表人证明文件等;
(2) 对外担保主合同、协议或标书及有关交易背景资料;
(3) 担保涉及的事项按规定须事先获得有关部门批准或核准的，须提供有关部门的批 准或核准文件;
(4) 经会计(审计)师事务所审计的上两年财务报表及当期财务报表;
(5) 反担保措施证明文件;
(6) 银行要求的其它资料。
2、银行进行调查、审查
银行收到申请和有关资料后，对申请人的合法性、财务状况的真实性、交易背景的真实性等进行调查，了解借款人的履约、偿付能力，对申请人的进行授信评级，向申请人做出正式答复。
3、 审批同意
审批同意后，签订《保函协议书》或《贷款承诺协议书》，申请人存入相应比例的保证金，办理抵质押或反担保手续，银行出具保函或贷款承诺书。
银行同意开立保函后，与申请人签订“开立担保协议”，约定担保种类、用途、金额、费率、担保有效期，付款条件，双方的权利、义务，违约责任和双方认为需要约定的其它事项;对于需提供反担保的，还应按银行要求办理反担保手续。
办理履约保函有两种方式：
1、通过银行直接办理，此时需要存入全额保证金，另付银行费用。
①申请履约保函：申请人向银行提交申请，并提供所需的资料和文件。
②调查和审查：银行会对申请人进行调查和审查，包括审核申请人的信用状况、财务状况以及履约能力。
③签订协议缴纳保证金：在履约保函办理过程中，申请人和银行会签订一份协议，明确双方权利和义务。通常要求申请人提供一定比例的履约保证金或者反担保，作为保函的信用支持。
④开立履约保函：经过审核和协议签订后，银行会开立履约保函。履约保函是银行向收益人(通常为业主或买方)发出的承诺，保证在申请人不履行合同义务时承担责任并给与赔偿。
2、通过担保公司办理，担保公司为客户向银行提供反担保，银行即可不收(或者部分收取)客户保证金办理保函，客户另付担保公司费用。
银行在收取保证金时，会考虑项目是建筑安装服务类，有对应的建设局颁发的一级及以上资质作为支撑，可以申请免保证金。
项目为市政工程，有与项目对应的建设局颁发二级以上资质作为支撑，可以申请免保证金。
资质为3级或无资质，一般不能免保证金，只能部分免除。
项目是采购供货类，一般是没有对应的资质的，所以不能免保证金。
项目和公司条件虽然没有达到银行的免保要求，但是保函的有效期短，或者项目风险可控，可以申请免除保证金的。