间接冷却是由鼓风机将库房内的空气抽吸进空气冷却装置，空气被盘旋于冷却装置内的蒸发管吸热后，再送入库内而降温。空气冷却方式的优点是冷却迅速，库内温度较均匀，同时能将贮藏过程中产生的二氧化碳等有害气体带出库外。
疫苗冷库制冷控制系统采用全自动微电脑电气控制系统，智能电脑温度控制，高精度温度传感器，全自动温度恒温，地洞开关机，具有自动报警，无需人工操作，数码温度显示，可选配温湿度记录仪，确保库内物品存放。
冷库设计要求：
（取自《冷库规程》第7章 ）
在氨制冷机房门口外侧便于操作的位置，应设置切段制冷系统电源的紧急控制装置，并应设置警示标识。每套制冷压缩机组启动控制柜（箱）及机组控制台应设紧急停机按钮。
制冷机房应装有事故排风装置。氨制冷机房的事故排风装置应采用防爆型。当制冷系统发生事故而被切断电源时，应能保证事故排风装置的可靠供电。
氨制冷机房、高低压配电室应设置应急照明，照明灯具应选用防爆型，照明持续时间不应小于30min。
氨制冷机房应安装氨气浓度检测报警装置及供水系统。
水冷却式制冷压缩机应设置断水保护。
机房门应向外开，且数量应确保人员在紧急情况下快速离开。
设在室外的制冷辅助设备应设防护栏，并设置警示标识。高压储液器设在室外时，应避免太阳直射。
库房内应采用防潮型照明灯具和开关。
库房内灯具安装高度小于或等于2.2m时，应采用电压供电。灯具金属外壳均应接保护线。
低于0度的库房内动力及照明线路，应采用适合库房温度的耐低温绝缘电缆。
穿过库房隔热层的电气线路，应采取可靠的防火措施。
冷库设计应满足消防的有关规定。
若有异味，必须经过技术处理，排除异味后方可使用。 平常要加强冷藏设备的维护，严禁倒堆卸货，防止因此砸坏管路，造成制冷剂外泄。 食品在冷加工过程中，必须使冷库库房保持一定的温度，不得将冻制食品进行转库或存放。若冷库库房温度降不下来，应查找原因，待排除后再行食品加工。 冷库内不得混合存放互相感染的食品。