首先是建立日常保管制度：
（一）公司印章采取分级保管的制度，各类印章由各岗位专人依职权需要领取并保管。
（二）印章必须由专门保管人妥善保管，不得擅自委托他人保管并在其岗位职责中予以明确。
（三）公章应妥善保管，注意，防止损毁、遗失和被盗。
其次是明确保管人责任：
（一）印章保管人必须妥善保管印章，不得遗失。如遗失，必须及时向公司办公室报告；
（二）必须严格依照公司对印章的使用规定使用印章，未经规定的程序，不得擅自使用；
（三）在使用中，保管人对文件和印章使用单签署情况予以审核，同意的则用印，否决的则退回；
（四）检查印章使用是否与所盖章的文件内容相符，如不符则不予盖章；
（五）在印章使用中违反规定，给公司造成损失的，由公司对违纪者予以处分，造成严重损失或情节严重的，移送有关机关处理。
公司聘用的人员被解聘后，或受单位委托保管公章的人员被解除委托后，公司未及时收回其公章，行为人擅自利用保留的公司公章签订经济合同，如果给被害人造成经济损失的，公司应承担赔偿责任。
公司日常运营中印章存在的风险
(1)他人使用假冒的印章;
(2)他人使用扫描打印出来的印章;
(3)对方使用的是没有备案、没有资质的内设部门章。
原子印章：印迹清晰、永不褪色、自带印油、使用方便， 可用万次，不可加油。适用于各类部门章：如发票专用章、合同专用章、业务专用章、报关专用章及其他工作用章等，不适用银行印鉴印章。紫、红、蓝、黑、绿五种颜色。